《科学》：纽约新冠病毒主要由欧洲和美洲引入

对于其余的进化枝（B，B1和B4），研究者鉴别在2月至3月初推断被引入纽约的4种SARS-CoV-2毒株（表1，节点7至10）。值得注意的是，其中两个引入毒株根据其与美国其他分离株的密切关系，可以推断为来自于美国国内，其中就包括在华盛顿州引发主要社区传播的分离株（进化枝B1，节点9）。最近有报道称，该进化枝上的毒株被引入了美国东海岸（纽约位于东海岸）。尽管进化枝B中一半以上的序列是亚洲起源的（图2B），但与纽约分离株最接近的亲戚是欧洲和北美起源的。

表1

前述测序分离株和进化枝在地理空间上，分布在纽约市所有的行政区和21个社区中（图3）。这与纽约其他医院中的测序分离株和进化枝时空分布相似。

图3

综上所述，研究结果表明，纽约的SARS-CoV-2流行病主要来自美国和欧洲之间的无追踪传播，该病原是从中国直接引入的证据非常有限。

尽管在2020年4月上旬可用的SARS-CoV-2基因序列数量相对较少，但该研究还是发现了位于进化枝A2a内的两个单系病毒簇，它们几乎完全包含来自纽约的分离株（图2B）。一簇包括进化枝A2a中23％（17个）的分离株和总测序分离株的20％。根据邮政编码信息，该集群的病例分布在五个县，包括一个来自韦斯特切斯特县新罗谢尔的样本，该样本是纽约市以北的大都市区的一部分，并报告了纽约州第一个记录在案的社区获得性感染群，报告时间是2020年3月3日。该簇的特征是ORF1b基因中的氨基酸取代A1844V。这些病毒簇的基础是来自明尼苏达州、华盛顿州和加利福尼亚州的分离株。纽约分离株和美国其他分离株之间的相关性表明，本地传播的病毒可能已经通过国内途径被引入纽约。

第二病毒簇是一个较小的群，其中包含来自曼哈顿的四个分离株和来自皇后区的一个分离株。邮编信息可用于曼哈顿的三个病例，这些病例对应三个不同的社区，进一步支持纽约发生了社区传播。尽管大多数纽约市病例主要与欧洲的病毒进化枝混杂在一起，但这些结果表明，在纽约市内，国内引进的病毒株也可能是早期社区传播的来源。

值得注意的是， CNN在4月连线采访美国顶级疾控专家福奇，他也表示，“根据旅行和航班记录发现，纽约新冠病毒源自意大利，而且是意大利北部。我对此并不感到意外。”

此前《纽约时报》也报道称，最新的基因研究表明，新冠病毒早在2月中旬就开始在纽约地区传播，也就是第一个确诊病例出现之前的几周，主要是来自欧洲的旅行者带来了这种病毒，而不是来自亚洲。

当地时间5月11日，纽约州州长科莫（Andrew Cuomo）在新冠肺炎每日简报时也再度强调，“攻击我们的病毒来自欧洲”。

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（编辑：辽源站长网）

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